Vecā Zapišķu Svētā Jāņa Kristītāja baznīca ir unikāls gotiskās arhitektūras piemērs un viena no senākajām Lietuvā, kas atrodas pie Nemunas upes krasta. Šī mazā baznīca, kuras vēsture sākas 14. gadsimtā, bieži tiek saukta par "baznīcu māti". Pirmo reizi dokumentos tā pieminēta 1562. gadā un ir pārdzīvojusi karus, ugunsgrēkus, plūdus un vairākus remontus. Neskatoties uz grūtībām, baznīca ir saglabājusies un kļuvusi par nozīmīgu Lietuvas kultūras un reliģijas mantojuma vietu. 20. gadsimta sākumā dievkalpojumi beidzās, bet 1936. gadā baznīca tika pārveidota par baznīcas īpašumu noliktavu.
Leģendas vēsta, ka baznīcas celtnieks bija Povils Sapega, kurš 16. gadsimta vidū apmetās Zapišķu muižā. Baznīca tika būvēta pēc gotikas
principiem, vietējiem amatniekiem būvējot sienas gotikas meistara vadībā. Interjeru rotāja freskas, iespējams, attēlojot Kauņu, un izcilas ērģeles ar kustīgu ķēniņa Dāvida skulptūru. Tiek stāstīts arī, ka ar Nemunas upes straumi tika atvesta Jaunavas Marijas glezna un alņa galvas galva kā ziedojums. Diemžēl Pirmā pasaules kara laikā vācu karavīri ērģeles un citus rotājumus aizveda.
Kopš 1996. gada baznīcā notiek kultūras pasākumi un koncerti, kas iekļauti Pažaisļa mūzikas festivāla programmā. Baznīca ir kļuvusi par nozīmīgu kultūras un vēsturisko objektu, piesaistot gan ticīgos, gan mākslas un kultūras cienītājus. Lai apmeklētu šo unikālo mantojuma vietu, visērtāk ir ierasties ar automašīnu, šķērsojot pļavu.