Baznīcas fasādi sākotnēji rotāja pilastri, augsti logi un arkas nišas, ko vainagoja trīsstūra frontons. Rekonstrukcijas laikā arhitekts Karolis Reisonas piešķīra fasādei modernizētus eklektiskus elementus: trīsstūra frontonu aizstāja pakāpienveida zelminis, un tika uzbūvēti divu līmeņu torņi ar dekoratīviem smailiem galiem. Vecā ķieģeļu zvanu torņa vietā baznīcas dārzā tika uzbūvēti jauni vārti, kas atkārto fasādes stilu.
Baznīcas kapenēs atdusas Kosakovsku dzimtas pārstāvji, tostarp pilsētas
dibinātāja Marijona Zabielaitė-Kosakovskienė, baznīcas mecenāts bīskaps Juozapas Kazimiras Kosakovskis un pēdējais Polijas–Lietuvas kopvalsts hetmanis Simonas Kosakovskis.
Arī baznīcas interjers atspoguļo tās bagāto vēsturi. 1936. gadā tika paplašināts ērģeļbalkons, un viss iekštelpu plānojums tika atjaunots saskaņā ar Karolisa Reisona projektu. Šī svētvieta apvieno arhitektūras izcilību un Jonavos vēstures stāstījumu, savijot kultūras, vēsturiskos un garīgos elementus vienotā veselumā.